POLGEN tarafından “Yeni Nesil Dizileme” ve “Biyoinformatik Analiz” hizmetleri sunulmaktadır.
Yeni Nesil Dizileme Hizmetleri
- 1. DNA Dizilemeleri
-
- Tüm genom dizileme (de novo)
- Tüm genom dizileme (yeniden dizileme “re-sequencing”)
- Ekzom dizileme
- Metagenom dizileme
- GBS (dizileme ile genotipleme, “genotyping by sequencing”)
- Hedeflenmiş bölge dizileme
- Amplikon dizileme
- Gen panelleri
-
- 2. RNA Dizilemeleri
-
- Total RNA dizileme
- mRNA dizileme
- Hedeflenmiş RNA dizileme
- Küçük RNA (sRNA, miRNA) dizileme
- Gen ifadesi profilleme
-
- 3. Epigenom Dizilemeleri
-
- Metilasyon profilleme
- Kromotin çöktürmülmüş DNA (ChIP) dizileme
- Bisulfit dizileme
-
- 4. Mikrobiyom Dizilemeleri
-
- Amplikon dizileme
- Metagenom dizileme
- De novo genom dizileme
-
- 5. Tek Hücre Dizilemeleri
-
- Tek hücre DNA dizileme
- Tek hücre RNA dizileme
-
Biyoinformatik Analiz Hizmetleri
1. Standart analizler
- Genom de novo asemblisi (hızalaması)
- Transkriptom de novo asemblisi (hızalaması)
- Genom haritalama
- Referans genom kullanılarak transkriptom haritalama
- Küçük RNA (sRNA) haritalama
- Genom atıflandırması (annotasyonu)
- Transkriptom atıflandırması (annotasyonu)
- sRNA (miRNA da dahil) atıflandırması (annotasyonu)
2. İleri seviye analizler
- GBS analizi
- Gen ifadesi profilleme
- Gen ontoloji analizi
- KEGG yolak analizi
- Kanser analizi (SNP/mutasyon/InDel analizleri)
- Kompleks hastalıklar analizleri
- Long non-coding RNA (lncRNA) analizleri
- Populasyon analizleri (haplotip yapı ve sıklığı, LD)
- Karşılaştırmalı genom analizleri
- Sinteni analizleri
- Mendelyan hastalıkları analizleri
This post is also available in: İngilizce
